标题：
基于SVM方法分析蛋白酶体裂解位点的特异性
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论文类型：
期刊论文
发表刊物：
化学学报
收录刊物：
SCIE、PKU、ISTIC、CSCD、Scopus
卷号：
66
期号：
21
页面范围：
2341-2347
ISSN号：
0567-7351
关键字：
支持向量机;蛋白酶体;抗原肽
摘要：
真核细胞中的泛素-蛋白酶体系统在抗原肽加工呈递途径中发挥着重要作用.为了进一步研究蛋白酶体的酶切位点特异性,采用支持向量机(support vector machine,SVM)方法建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型.在相同检验集下,将本模型性能指标与其他预测模型方法比较,结果是本模型性能指标优先,预测准确度为83.1%.由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数,得出蛋白酶体酶切位点及其两侧区域氨基酸的裂解特异性,反映了蛋白酶体裂解抗原蛋白的相互作用信息,这表明蛋白酶体对抗原蛋白的酶切处理不是随机的,而是有一定模式和选择性的.
发表时间：
2008-11-14
学位：学士
职称：教授
所在单位：计算机基础教学实验中心