标题:
应用独立成分分析方法预测CTL表位
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论文类型:
期刊论文
发表刊物:
化学学报
收录刊物:
SCIE、PKU、ISTIC、CSCD
卷号:
68
期号:
18
页面范围:
1821-1828
ISSN号:
0567-7351
关键字:
CTL表位;独立成分分析;氨基酸描述符;定量构效关系
摘要:
基于独立成分分析方法分别采用3 z-scale和5 z-scale氨基酸结构描述符,建立了抗原肽与MHC分子(major histocompatibility complex,MHC)相互作用结合的定量构效关系模型.该两个模型训练集样本数是316,预测集样本数是786.结果表明:3 z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.3%,0.70;5 z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.90/0,0.79.本文建立CTL表位预测模型对进一步了解抗原肽与MHC I类分子相互作用机理具有一定的帮助.
发表时间:
2010-09-28