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基元通量模式预测酵母生长现象

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Indexed by:期刊论文

Date of Publication:2006-09-10

Journal:高等学校化学学报

Included Journals:SCIE、PKU、ISTIC、CSCD、Scopus

Volume:27

Issue:9

Page Number:1683-1685

ISSN No.:0251-0790

Key Words:预测;基元通量模式;啤酒酵母;生长现象

Abstract:基元通量模式(Elementary flux mode, EFM)[1]是以计量学为基础, 通过枚举输入物到达目的产物过程中的路径来表示代谢过程, 路径数的多少表示生长能力的强弱. 而同属于计量学范畴的通量平衡分析(Flux balance analysis, FBA)[2]需设定输入物的量, 通过实现最大化目标函数来计算最多能够生成的生物质量. 在预测生物体的生长现象和规律方面, EFM和FBA分别能够做到定性预测和定量预测. 本文通过EFM预测了基因突变后的酵母细胞生长现象, 模拟预测结果和实验结果[3]吻合很好; 与FBA方法得到的模拟结果[3]相比较, EFM方法能更好地把基因突变和其表型(生长)联系起来.

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