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MS-IAS:集成的质谱代谢组学数据分析系统

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Indexed by:期刊论文

Date of Publication:2012-09-01

Journal:分析化学

Included Journals:SCIE、CSCD、SSCI

Volume:40

Issue:9

Page Number:1366-1373

ISSN No.:0253-3820

Key Words:代谢组学;质谱;特征选择;分类;聚类

Abstract:针对代谢组学研究中的数据处理问题,本研究建立了基于质谱的数据分析系统MS-IAS(Mass spectrometry based integrated analysis system).此系统集成了特征选择、聚类、分类等多种方法,用以处理质谱数据,具有多种统计分析方法能对所选的特征变量进行比较,以发现与所研究问题相关的潜在生物标志物.MS-IAS支持数据与多种算法结果可图形化显示,有助于对数据的解释与分析.以肝病患者的质谱代谢组数据为例,展示MS-IAS的功能,两种特征选择算法从数据集中筛选出了40个对肝病具有区分能力的特征变量,展示了MS-IAS成为代谢组学研究中的通用质谱数据分析系统的潜力.

Pre One:A novel approach to transforming a non-targeted metabolic profiling method to a pseudo-targeted method using the retention time locking gas chromatography/mass spectrometry-selected ions monitoring

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