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耐旱相关基因SiUPF3的克隆表达及生物信息学分析

Release Time:2019-03-11  Hits:

Indexed by: Journal Article

Date of Publication: 2015-01-01

Journal: 植物生理学报

Included Journals: CSCD、ISTIC、Scopus

Volume: 51

Issue: 4

Page Number: 509-516

ISSN: 2095-1108

Key Words: 谷子; 耐旱基因; ABA途径; 实时定量PCR

Abstract: Upf3蛋白参与一种保守的mRNA降解系统即无义介导衰变(nonsense-mediated decay,
   NMD)。它主要存在于真核细胞中参与降解异常的mRNA。本文通过比较晋谷34正常生长和干旱胁迫下谷子表达谱基因相对表达量的变化幅度大小,
   筛选得到一个响应干旱同时能够编码Upf3蛋白的基因, 经谷子基因组在线数据查询并比对得到全长基因Si009903m的编码序列(coding
   sequence, CDS), 克隆该基因的CDS并命名为SiUPF3。SiUPF3长1 515 bp,
   编码504个氨基酸。经实时定量PCR分析表明SiUPF3受ABA途径调控, 并且在干旱胁迫下显著上调。

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