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Indexed by:期刊论文

Date of Publication:2012-01-01

Journal:大连理工大学学报

Included Journals:Scopus、EI、PKU、ISTIC、CSCD

Volume:52

Issue:4

Page Number:476-480

ISSN No.:1000-8608

Key Words:百合无症病毒; 衣壳蛋白; 序列分析; 功能预测

Abstract:根据已报道的LSV
   CP基因序列合成两条寡聚核苷酸引物,模板为感染LSV的百合叶片的总RNA,通过反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增出大小为876bp的LS
   V
   CP基因,经测序后,对该基因编码区全长序列及相应的氨基酸序列用生物信息学软件系统进行序列分析及结构功能预测.结果表明:该基因由876个核苷酸组成
   ,编码291个氨基酸;与GeneBank公布的其他LSV分离物的基因序列同源性为93.4%~99.0%,氨基酸同源性为84.8%~99.5%;它
   含有一个卷曲螺旋结构和多个磷酸化位点,平均疏水值为-0.432;含有Carlaviruses完整的衣壳蛋白保守结构域,二级结构以alpha-螺旋
   和无规则卷曲为主.