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分子对接技术在色谱配基筛选中的应用与优化

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Indexed by:期刊论文

Date of Publication:2008-05-15

Journal:计算机与应用化学

Included Journals:PKU、ISTIC、CSCD

Volume:25

Issue:5

Page Number:541-544

ISSN No.:1001-4160

Key Words:固定化配基;筛选;对接;相互作用

Abstract:分子对接技术是药物虚拟筛选的重要手段,将它应用到固定化配基与蛋白质相互作用的研究中需要改进.以目标蛋白质整体为研究对象,采用不同大小的滚球分子计算生成不同的蛋白质表面,分析在不同表面上的对接结果与配基吸附容量间的相关性.结果表明固定化配基与蛋白质相互作用主要发生在蛋白质表面上,并在以滚球分子半径5.0 A计算生成的蛋白质表面上的对接结果更能反映固定化配基与蛋白质的真实作用.

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