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论文类型：期刊论文

发表时间：2015-08-15

发表刊物：分子科学学报

收录刊物：PKU、ISTIC、CSCD

卷号：31

期号：4

页面范围：295-303

ISSN号：1000-9035

关键字：ROCK激酶抑制剂;比较分子力场;比较相似性指数分析;分子对接

摘要：基于计算生物学方法对61个ROCK激酶靶标分子建立三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.在基于配体叠合的基础上,发现CoMSIA中2个场组合(位阻场和疏水场)为最好的模型(Q2 =0.509,R2ncv=0.987,SEE=0.131,F=287.999和RR2pre=0.837).基于此模型基础上的三维等势线图形象地说明了在各个位置增加疏水性的大取代基或者亲水性基团有利于提高分子的生物活性.此外,分子对接模拟结果显示了氨基酸Glu170,Met172和Asp232在受体调节剂中发挥着重要作用.这些结果能够帮助深入了解ROCK激酶的作用机理,并且能够为今后的药物设计提供新的方向.