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论文类型：期刊论文

发表时间：2011-12-15

发表刊物：计算机科学

收录刊物：PKU、ISTIC、CSCD

卷号：38

期号：12

页面范围：232-235

ISSN号：1002-137X

关键字：蛋白质关系网络;网络可视化;图聚类;JUNG工具包

摘要：蛋白质关系网络的研究在生物医学领域中已成为一个热点.研究者通过对蛋白质关系网络进行分析和聚类,能够发现其中的复合体,进一步理解细胞组织原理.在对关系网络进行分析的过程中,将网络拓扑显示为图形,以直观地表示出关系网络的结构,便于对比聚类方法,辅助关系网络的研究.利用网络建模与可视化工具包JUNG设计并实现了一个蛋白质关系网络可视化系统,它能够解析多种格式的蛋白质关系网络数据,集成了几种有效的图聚类算法,并实现了一种基于蛋白质功能标注的发现复合体的聚类算法.用户能够通过二维网络视图方便地观察原始网络和聚类后的结果.