王健

个人信息Personal Information

教授

博士生导师

硕士生导师

性别:女

毕业院校:大连理工大学

学位:博士

所在单位:计算机科学与技术学院

学科:计算机应用技术

办公地点:创新园大厦B811

联系方式:0411-84706009-2811

电子邮箱:wangjian@dlut.edu.cn

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论文成果

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基于修正网络的蛋白质络合物预测

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论文类型:会议论文

发表时间:2009-11-14

页面范围:460-469

关键字:蛋白质络合物;蛋白质关系网络;指标权重

摘要:蛋白质络合物在很多生物学过程中起到了关键的作用,是深入理解细胞组织原理的基础。随着生物高通量技术的不断发展和广泛应用,蛋白质相互关系的数据量随之不断膨胀,这些数据为蛋白质络合物的提取提供了新的视角。但是高通量技术在预测蛋白质相互关系时存在高错误率。与传统的直接使用蛋白质关系网络预测不同,算法通过迭代的计算蛋白质之间的权重,来判断哪些相互关系更有价值。提取那些权重较大的相互关系,这些权重较大的关系可以很大程度上去除噪音关系的影响。在考虑了一阶和二阶关系的基础上构造新的相似性关系网络。在此关系网络的基础上,分别计算络合物的核蛋白质集合和附属蛋白质集合,从而避免了噪音关系带来的影响,同时引入了络合物结构信息。实验结果表明,这种方法在识别蛋白质络合物上是高效和实用的。