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论文类型：期刊论文

发表时间：2015-01-07

发表刊物：计算机工程

收录刊物：PKU、ISTIC、CSCD

卷号：41

期号：11

页面范围：207-212

ISSN号：1000-3428

关键字：蛋白质相互作用关系抽取;丰富特征;支持向量机;最大熵;图核

摘要：从生物医学文献中自动地抽取蛋白质相互作用(PPI)关系是文本挖掘的一项重要任务.考虑到特征和分类器的选择对于PPI任务的重要性,提出一种基于丰富特征和多分类器融合的蛋白质关系抽取方法.选取15种词法、句法及语义特征,融合3种分类器,采用文档级别的10倍交叉验证方法,在5个公开的PPI基准语料上进行评估实验,结果表明,该方法在AIMed语料上取得的F值和AUC值分别为63.7％和87.8％,具有良好的抽取性能.