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个人信息Personal Information
教授
硕士生导师
性别：女
毕业院校：九州工业大学
学位：博士
所在单位：生物工程学院
学科：生物工程与技术. 生物化学与分子生物学. 药剂学
办公地点：生物工程学院（西部校区）
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Apicidin选择性抑制ClassⅠ HDACs分子动力学研究
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论文类型：期刊论文
发表时间：2010-02-10
发表刊物：高等学校化学学报
收录刊物：PKU、ISTIC、CSCD、SCIE
卷号：31
期号：2
页面范围：374-378
ISSN号：0251-0790
关键字：组蛋白脱乙酰酶抑制剂;组蛋白去乙酰化酶(HDACs);分子动力学;同源模建;分子对接
摘要：采用模拟方法研究组蛋白脱乙酰酶抑制剂(Apicidin)选择性抑制组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases, HDACs)中的HDAC1和HDAC8. 通过HDAC8晶体结构同源模建HDAC1三维结构模型, 将Apicidin分别与HDAC1和HDAC8对接并进行分子动力学模拟, 结果表明, HDAC1活性口袋入口处的Arg270是Apicidin-HDAC1形成稳定结构的重要因素;HDAC1中Tyr303及His178与Apicidin形成2个持续存在的氢键, 而在HDAC8中未发现, 这是Apicidin选择性抑制HDAC1高于HDAC8的另一重要原因.