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论文类型：期刊论文

发表时间：2014-01-01

发表刊物：蚕业科学

收录刊物：PKU、ISTIC、CSCD

卷号：40

期号：5

页面范围：843-850

ISSN号：0257-4799

关键字：柞蚕吐白水软化病; 传染性软腐病病毒属; RNA解旋酶; 3C半胱氨酸蛋白酶; RNA依赖性的RNA聚合酶

摘要：从患柞蚕吐白水软化病的病蚕体内分离到一株传染性软腐病病毒属(Iflavirus)病毒。研究柞蚕传染性软腐病病毒基因组结构及主要功能蛋白的结构域,
   为确定该病毒株的分类学地位和阐释其侵染机制提供基础信息。克隆了编码柞蚕传染性软腐病病毒功能蛋白的RNA 解旋酶基因(423 bp)、3C
   半胱氨酸蛋白酶基因(405 bp)以及 RNA 依赖性的RNA 聚合酶基因(882
   bp)。通过同源模建方法,构建了柞蚕传染性软腐病病毒3个功能蛋白的三维结构模型,并采用拉氏图和Profile 3D
   等方法验证了模型的可靠性。将柞蚕传染性软腐病病毒中 RNA 依赖性的RNA 聚合酶序列与另外16个小 RNA
   病毒同源序列进行比对并构建系统发育树,显示柞蚕传染性软腐病病毒与蜜蜂残翅病病毒和蜜蜂瓦螨虫病毒的亲缘关系十分相近。