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分子动力学方法研究菊粉水解过程

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Indexed by:会议论文

Date of Publication:2016-07-01

Page Number:1-1

Key Words:菊粉酶;水解;分子动力学模拟;分子对接

Abstract:  菊粉是一种自然界广泛存在的糖类,近年来被广泛运用于食品添加剂、工业制乙醇等。通过研究内切菊粉酶对菊粉的水解过程,可以有效得到菊粉水解过程的关键氨基酸,对于提高工业产量十分有益。本文结合菊粉多聚合度的性质,建立两组菊粉分子(有葡萄糖,无葡萄糖)共13个配体分子与菊粉酶进行分子对接,运用Amber 14软件在AMBER力场下进行100ns分子动力学模拟,通过计算菊粉酶与不同菊粉分子的残基作用,可以分析菊粉在不同水解度下与菊粉酶的相互作用情况,得到菊粉酶水解过程的作用机理。

Pre One:Application of redox potential control to improve ethanol productivity from inulin by consolidated bioprocessing

Next One:一种逐步增长肽段的柔性对接过程