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利用化学相似性和分子对接方法寻找LRRK2的抑制剂

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Date of Publication:2016-07-01

Page Number:1-1

Key Words:LRRK2;化学相似性;分子对接

Abstract:  发生在富亮氨酸重复激酶2(LRRK2)上的突变会引起帕金森症(PD).生物化学证据表明,LRRK2与GTP的结合活性可以调节LRRK2激酶的活性,这可能是神经毒性和PD发病的基础.因此,GTP结合区域,即LRRK2中的ROC是易处理的潜在药物靶点.以GTP结合位点为目标的化学小分子可用于调节LRRK2的行为,也可利于新的PD治疗药物的开发.本文采用一种虚拟筛选的方法寻找LRRK2的抑制剂.首先,利用三种已知的LRRK2抑制剂在ZINC数据库中进行化学相似性搜索.相似度大于80%的小分子用DOCK 6.7与LeDock对接软件与LRRK2的GTP结合位点进行分子对接.我们利用DOCK打分,LeDock打分和结合两者的打分结果进行排序.排名靠前的小分子进一步用更加严格的Lipinski规则.本研究提供了201个小分子供实验验证.

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