赵雨靓    博士  助理研究员/博士后

Email: zhaoyujing@dlut.edu.cn

地址: 辽宁省大连市甘井子区凌工路2号大连理工大学西部校区知微楼

科研情况

赵雨靓，博士，大连理工大学生物工程学院助理研究员/博士后。围绕深度学习算法开展药物设计、mRNA序列优化、LNP设计等相关研究工作。主持国家自然科学基金青年项目、国家资助博士后研究人员计划（C档）、中国博士后科学基金面上项目等。近5年发表SCI论文15篇(一作&通讯8篇)，包括AIChE J.、Smart Mol.等。

教育科研经历

·    2024.6-今              大连理工大学生物工程学院        助理研究员/博士后(导师: 林佳奇 教授, 青拔)

·    2020.9-2024.5       大连理工大学化学工程                博士(导师: 都健 教授; 张磊 教授, 优青)

·    2017.9-2020.6       大连理工大学化学工程                硕士(导师: 李燕 副教授)

·    2013.9-2017.6       大连理工大学化学工程与工艺    学士

研究方向

·    AI驱动的药物设计

       AI设计小分子药物、AI设计多肽、单抗等生物药

·    mRNA序列优化设计

       AI设计mRNA序列，提高生物药翻译效率

·    LNP递送系统设计

       AI设计LNP结构，提高mRNA递送效率

科研项目

[1] 国家自然科学基金青年科学基金项目、国家自然基金委，22508032，基于大语言模型与机器学习势函数的融合蛋白PROTAC药物优化设计方法，2026.01-2028.12，总经费30万，项目负责。

[2] 2025年度国家资助博士后研究人员计划（C档）、中国博士后科学基金，GZC20250809，基于符号回归模型与贝叶斯优化算法的LNP 递送系统智能设计方法，2025.07-2027.07，总经费24万，项目负责。

[3] 中国博士后科学基金第77批面上项目、中国博士后科学基金，2025M771190，基于大语言模型的高蛋白表达mRNA 药物优化设计方法，2025.06-2027.06，总经费8万，项目负责。

[4] 辽宁省博士启动项目拟立项项目公示、省博士科研启动基金计划项目，基于大语言模型的mRNA药物设计及其联合自然杀伤细胞在肺癌免疫治疗中的应用，2026.01-2027.12，总经费5万，项目负责。

[5] 大连理工大学AI4S交叉研究基金、中央高校基本科研业务费项目，2024.07-2025.07，总经费20万，项目负责。

获奖情况

[1] 赵雨靓, 大连理工大学招生宣传工作先进个人, 2024.12；

[2] 刘奇磊、张磊、赵雨靓, 第二十一届“攀登杯”创新创业竞赛一等奖, 2025.05；

[3] 杨君，孜力汗，林佳奇，都书博，赵雨靓，2025年“IGEM国际基因工程机器大赛”金奖，2025.11;

[4] 赵雨靓, 大连高校2024届优秀毕业生, 2024.04；

[5] 赵雨靓, 大连理工大学优秀毕业生, 2024.05；

[6] 赵雨靓, 大连理工大学优秀研究生, 2022.10；

代表论文

1. Zhao, Y., Liu, Q.*, Wu, X., Zhang, L., Du, J.*, Meng, Q., De novo drug design framework based on mathematical programming method and deep learning model. AIChE Journal, 2022, 68.9: e17748. SCI: 000806241100001, IF: 4(3.8), 他引: 25次, JCR: Q2 (ENGINEERING, CHEMICAL)                               

2. Yujing Zhao, Juntao Wang, Yuxin Song, Qilei Liu*, Jiaqi Lin*., Accelerating Siloxane-based Ionizable Lipid Design for LNPs with Data-Efficient Kolmogorov-Arnold Networks. Journal of Chemical Information and Modeling, 2026. SCI: 001684141900001, IF: 5.3 (6.3), 他引: 0次, JCR: Q1 (CHEMISTRY, MEDICINAL)                     

3. Zhao, Y., Zhang, L., Du, J., Meng, Q., Zhang, L., Wang, H., Sun, L., Liu, Q.*, Mixture-of-Experts Based Dissociation Kinetic Model for De Novo Design of HSP90 Inhibitors with Prolonged Residence Time. Journal of Chemical Information and Modeling, 2024, 64.22: 8427-8439. SCI: 001349187800001, IF: 5.3 (6.3), 他引: 6次, JCR: Q1 (CHEMISTRY, MEDICINAL)                         

4. Yujing Zhao, Sheng Xiang, Jian Du, Qingwei Meng, Jianbing Chen, Ming Gao, Bing Xing, Qilei Liu*, Lei Zhang*, Computer-aided Amine Solvent Design for Carbon Capture based on Desorption Thermodynamic and Reaction Kinetic Models. Separation and Purification Technology, 2025, 360: 130984. SCI: 001389368900001, IF: 9 (8.5), 他引: 5次, JCR: Q1 (ENGINEERING, CHEMICAL)                               

5. Zhao, Y., Liu, Q.*, Du, J., Meng, Q., Zhang, L.*, Machine learning methods for developments of binding kinetic models in predicting protein-ligand dissociation rate constants. Smart Molecules, 2023, 1.3: e20230012. 前沿科学新刊，预计IF＞15, 他引: 27次    

6. Zhao, Y., Liu, Q., Du, J., Meng, Q., Sun, L., Zhang, L.*, Accelerating Factor Xa inhibitor discovery with a de novo drug design pipeline. Chinese Journal of Chemical Engineering, 2024, 72: 85-94. SCI: 001281443500001, IF: 3.7 (3.8), 他引: 3次, JCR: Q2 (ENGINEERING, CHEMICAL)  

7. Zhao, Y., Liu, Q., Du, J., Meng, Q., Sun, L., Zhang, L.*, High-throughput and intelligent design of potential GRK2 inhibitor candidates using deep learning and mathematical programming methods. Chinese Journal of Chemical Engineering, 2025, 84, 11-22. SCI: 001608785700001, IF: 3.7 (3.8), 他引: 0次, JCR: Q2 (ENGINEERING, CHEMICAL) 

8. Guo, L., Zhao, Y., Liu, Q.*, Zhang, L., Du, J., Meng, Q.*, Temperature-dependent small-molecule solubility prediction using MoE-enhanced directed message passing neural networks. Journal of Chemical Information and Modeling, 2025, 65.14: 7463-7477. SCI: 001526024000001, IF: 5.3 (6.3), 他引: 2次, JCR: Q1 (CHEMISTRY, MEDICINAL) 

9. Wu, G., Zhao, Y., Zhang, L., Du, J., Meng, Q., Liu, Q.*, Machine learning potential model for accelerating quantum chemistry-driven property prediction and molecular design. AIChE Journal, 2025, 71.5: e18741. SCI: 001406927400001, IF: 4(3.8), 他引:7次, JCR: Q2 (ENGINEERING, CHEMICAL)  

10. Xinhao Che; Yujing Zhao; Qilei Liu; Fang Yu; Hanyu Gao; Lei Zhang., CSstep: Step-by-step exploration of the chemical space of drug molecules via multi-agent and multi-stage reinforcement learning. Chemical Engineering Science, 2025, 317, 122048. SCI: 001513944200004, IF: 4.3 (4.3), 他引: 4次, JCR: Q2 (ENGINEERING, CHEMICAL) 

11. Tang, Kun; Zhao, Yujing; Zhang, Lei; Du, Jian; Meng, Qingwei; Liu, Qilei, Accelerating transition state search and ligand screening for organometallic catalysis with reactive machine learning potential. Journal of Chemical Theory and Computation, 2025, 21(18), 8933-8949, SCI: 001568363500001, IF: 5.5 (6.4), 他引: 2次, JCR: Q1 (PHYSICS, ATOMIC, MOLECULAR & CHEMICAL)                               

12. Wu, G., Zhao, Y., Luo, G., Du, J., Meng, Q., Liu, Q., & Zhang, L., Machine Learning-Augmented COSMO-SAC Model for Accurate Screening of Green Deep Eutectic Solvents in Sustainable CO2 Capture. ACS Sustainable Chemistry & Engineering, 2025, 14.1: 376-388, SCI: 001645727200001, IF: 7.3 (8), 他引: 0次, JCR: Q1 (CHEMISTRY, MULTIDISCIPLINARY)                           

软件著作权

1. 软著, 二作, 刘奇磊, 赵雨靓, 张磊, 都健, 孟庆伟. DrugCAMD基于数学规划模型的高通量药物分子优化设计软件. 登记号: 2022SR0622099, 登记日期: 2022.05.23. 

2. 软著, 三作, 刘奇磊, 吴国訢, 赵雨靓, 张磊, 都健, 孟庆伟. DeePEST基于深度学习的分子势能面预测工具软件, 登记号: 2024SR1284251, 登记日期: 2024.09.02.

发明专利

1. 专利, 一作, 赵雨靓, 林佳奇. 一类增强mRNA 翻译效率的mRNA 5'UTR 序列及其应用.申请号: 202511405290.2. 申请日: 2025. 09. 29. (实质审查阶段) 

2. 专利, 二作, 刘奇磊, 赵雨靓. 一种基于数学规划法与骨架-基团耦合的分子智能设计方法. 申请号: 202610221656.9. 申请日: 2026. 02. 25. 

3. 专利, 二作, 张磊, 赵雨靓, 刘奇磊, 都健, 孟庆伟. 一种化合物在抑制Xa因子方面的应用, 申请号: 202410026908.3, 申请日:2024. 01. 09. (公开状态)

4. 专利, 二作, 刘奇磊, 赵雨靓, 王俊涛. 一种基于符号回归KAN的分子构效关系建模方法. 申请号: 202610223218.6. 申请日: 2026. 02. 25. 

5. 专利, 三作, 刘奇磊, 都健, 赵雨靓, 张磊, 吴心远, 孟庆伟. 基于门控注意力机制的靶标-配体结合亲和力的深度学习预测方法. 专利号: ZL 202210394865.5.（授权） 

6. 专利, 三作, 刘奇磊, 张磊, 赵雨靓, 都健, 孟庆伟. 一种优化的从头药物设计方法. 专利号: ZL 202210396113.2.（授权）