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论文类型：期刊论文

发表时间：2010-02-10

发表刊物：高等学校化学学报

收录刊物：PKU、ISTIC、CSCD、SCIE

卷号：31

期号：2

页面范围：374-378

ISSN号：0251-0790

关键字：组蛋白脱乙酰酶抑制剂;组蛋白去乙酰化酶(HDACs);分子动力学;同源模建;分子对接

摘要：采用模拟方法研究组蛋白脱乙酰酶抑制剂(Apicidin)选择性抑制组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases, HDACs)中的HDAC1和HDAC8. 通过HDAC8晶体结构同源模建HDAC1三维结构模型, 将Apicidin分别与HDAC1和HDAC8对接并进行分子动力学模拟, 结果表明, HDAC1活性口袋入口处的Arg270是Apicidin-HDAC1形成稳定结构的重要因素;HDAC1中Tyr303及His178与Apicidin形成2个持续存在的氢键, 而在HDAC8中未发现, 这是Apicidin选择性抑制HDAC1高于HDAC8的另一重要原因.