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基元通量模式预测酵母生长现象

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论文类型：期刊论文
发表时间：2006-09-10
发表刊物：高等学校化学学报
收录刊物：SCIE、PKU、ISTIC、CSCD、Scopus
文献类型：J
卷号：27
期号：9
页面范围：1683-1685
ISSN号：0251-0790
关键字：预测;基元通量模式;啤酒酵母;生长现象
摘要：基元通量模式(Elementary flux mode, EFM)[1]是以计量学为基础, 通过枚举输入物到达目的产物过程中的路径来表示代谢过程, 路径数的多少表示生长能力的强弱. 而同属于计量学范畴的通量平衡分析(Flux balance analysis, FBA)[2]需设定输入物的量, 通过实现最大化目标函数来计算最多能够生成的生物质量. 在预测生物体的生长现象和规律方面, EFM和FBA分别能够做到定性预测和定量预测. 本文通过EFM预测了基因突变后的酵母细胞生长现象, 模拟预测结果和实验结果[3]吻合很好; 与FBA方法得到的模拟结果[3]相比较, EFM方法能更好地把基因突变和其表型(生长)联系起来.

上一条：基于分子参数的细胞色素P450 2C9抑制剂预测模型

下一条：基于3D-药效团的P糖蛋白和细胞色素P4503A4的协同作用机理研究

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