李丽双
个人信息Personal Information
教授
博士生导师
硕士生导师
性别:女
毕业院校:大连理工大学
学位:博士
所在单位:计算机科学与技术学院
学科:计算机应用技术. 计算机软件与理论
办公地点:创新大厦A930
电子邮箱:lils@dlut.edu.cn
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基于迁移学习的蛋白质交互关系抽取
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论文类型:期刊论文
发表时间:2016-01-01
发表刊物:中文信息学报
收录刊物:PKU、ISTIC、CSCD
卷号:30
期号:2
页面范围:160-167
ISSN号:1003-0077
关键字:蛋白质交互关系抽取; 迁移学习; 负迁移
摘要:作为生物医学信息抽取领域的重要分支,蛋白质交互关系(Protein-Protein
Interaction,PPI)抽取具有重要的研究意义。目前的研究大多采用统计机器学习方法,需要大规模标注语料进行训练。训练语料过少,会降低关系
抽取系统的性能,而人工标注语料需要耗费巨大的成本。该文采用迁移学习的方法,用大量已标注的源领域(其它领域)语料来辅助少量标注的目标领域语料(本领
域)进行蛋白质交互关系抽取。但是,不同领域的数据分布存在差异,容易导致负迁移,该文借助实例的相对分布来调整权重,避免了负迁移的发生。在公共语料库
AIMed上实验,两种迁移学习方法获得了明显优于基准算法的性能;同样方法在语料库IEPA上实验时,TrAdaboost算法发生了负迁移,而改进的
DisTrAdaboost算法仍保持良好迁移效果。