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副教授
博士生导师
硕士生导师
性别:男
毕业院校:大连理工大学
学位:博士
所在单位:生物工程学院
联系方式:13342277088
电子邮箱:biolwl@dlut.edu.cn
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耐旱相关基因SiUPF3的克隆表达及生物信息学分析
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论文类型:期刊论文
发表时间:2015-01-01
发表刊物:植物生理学报
收录刊物:Scopus、ISTIC、CSCD
卷号:51
期号:4
页面范围:509-516
ISSN号:2095-1108
关键字:谷子; 耐旱基因; ABA途径; 实时定量PCR
摘要:Upf3蛋白参与一种保守的mRNA降解系统即无义介导衰变(nonsense-mediated decay,
NMD)。它主要存在于真核细胞中参与降解异常的mRNA。本文通过比较晋谷34正常生长和干旱胁迫下谷子表达谱基因相对表达量的变化幅度大小,
筛选得到一个响应干旱同时能够编码Upf3蛋白的基因, 经谷子基因组在线数据查询并比对得到全长基因Si009903m的编码序列(coding
sequence, CDS), 克隆该基因的CDS并命名为SiUPF3。SiUPF3长1 515 bp,
编码504个氨基酸。经实时定量PCR分析表明SiUPF3受ABA途径调控, 并且在干旱胁迫下显著上调。