教授 博士生导师 硕士生导师
性别：男
毕业院校：东北师范大学
学位：博士
所在单位：生物工程学院
学科：生物化工
生物化学与分子生物学
生物工程
办公地点：生物工程学院401室
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发布时间：2019-03-10
论文类型：期刊论文
发表时间：2013-10-29
发表刊物：遗传
收录刊物：CSCD、ISTIC、PKU、PubMed、Scopus
卷号：36
期号：1
页面范围：69-76
ISSN号：0253-9772
关键字：miRNA;番茄;生物信息学;靶基因;启动子
摘要：MicroRNAs(miRNAs)是一类在真核生物体内普遍存在的、长度约22nt的内源性非编码小分子RNA,它通过与靶mRNA的结合参与多种基因的表达调控.番茄作为一种重要的模式植物,其miRNA的研究近年来也取得了较大的进展.文章通过搜集已报道的文献和miRBase,找到番茄中34个miRNA的表达与致病相关,采用生物信息学方法预测它们的靶基因,利用Cytoscope软件构建miRNA及其靶基因的调控网络.从中筛选出13个与致病密切相关的miRNA,根据各miRNA之间关联性的大小及其与致病相关靶基因的多少,进一步选出miR169、miR482、miR5300、miR6024、miR6026和miR6027,并对其进行了靶基因功能分析、启动子分析及实时定量PCR验证,为全面深入研究miRNA的作用机制奠定了基础.
