Release Time:2019-03-10  Hits:

Indexed by: Journal Article

Date of Publication: 2003-12-28

Journal: 计算机与应用化学

Included Journals: CSCD、ISTIC、PKU

Volume: 20

Issue: 6

Page Number: 719-723

ISSN: 1001-4160

Key Words: SARS;序列比较;信息熵;系统发育

Abstract: 多序列比较是分子生物学中的一个基本问题,本文利用一种新型信息离散性度量方法--FDOD方法,将其应用于SARS病毒研究中,对SARS病毒与已知的三类冠状病毒的复制酶、M蛋白、N蛋白和S蛋白进行了进化分析,得出的系统发育树与现有的生物分析基本一致.同时进一步显示了FDOD方法的优点,数学基础好,不带有主观因素,能比较客观地度量生物序列间的差异,且计算过程简单快速,是分子进化研究的一种有效工具.