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蛋白质折叠预测的禁忌搜索粒子群算法

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Indexed by:期刊论文

Date of Publication:2011-08-21

Journal:计算机工程与应用

Included Journals:ISTIC、CSCD

Volume:47

Issue:24

Page Number:46-50

ISSN No.:1002-8331

Key Words:粒子群算法;禁忌搜索;粒子变异;三维AB非晶格模型

Abstract:针对PSO算法晚期收敛速度慢、求解精度差的缺点,提出了一种改进优化算法——将粒子群算法(Particle Swarm Optimization,PSO)与禁忌搜索算法(Tabu Search,TS)结合起来解决基于三维AB非晶格模型的蛋白质折叠预测问题.TS算法的引入提高了粒子群收敛后期的精度,粒子变异机制增强了粒子跳出局部极小值的能力.真实数据实验表明,该算法计算出的蛋白质序列能量值相比其他算法有更高的精确度,能够更好地模拟蛋白质构象,是分析蛋白质结构的一种有效方法.

Pre One:一种使用视觉反馈与行为记忆的蚁群优化算法

Next One:用于图像场景分类的空间视觉词袋模型