Release Time:2019-03-10  Hits:

Indexed by: Journal Article

Date of Publication: 2010-02-10

Journal: 高等学校化学学报

Included Journals: SCIE、CSCD、ISTIC、PKU

Volume: 31

Issue: 2

Page Number: 374-378

ISSN: 0251-0790

Key Words: 组蛋白脱乙酰酶抑制剂;组蛋白去乙酰化酶(HDACs);分子动力学;同源模建;分子对接

Abstract: 采用模拟方法研究组蛋白脱乙酰酶抑制剂(Apicidin)选择性抑制组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases, HDACs)中的HDAC1和HDAC8. 通过HDAC8晶体结构同源模建HDAC1三维结构模型, 将Apicidin分别与HDAC1和HDAC8对接并进行分子动力学模拟, 结果表明, HDAC1活性口袋入口处的Arg270是Apicidin-HDAC1形成稳定结构的重要因素;HDAC1中Tyr303及His178与Apicidin形成2个持续存在的氢键, 而在HDAC8中未发现, 这是Apicidin选择性抑制HDAC1高于HDAC8的另一重要原因.